Kako je bakarska škola 1903. useljena u novu veliku zgradu povećao se broj učenika. Ravnatelj Vjekoslav Baborsky smatrao je potrebnim nabavku većeg broda te je s tim u vezi podnio izvještaj Vladi u Zagreb. Ovaj put išlo se na gradnju potpuno novog broda. Nakon toga dobivena je 1907. ponuda brodogradilišta u Kielu, o gradnji broda za 180.000 maraka. Novi školski brod sagrađen je kao brik-škuna, imao je dva jarbola i parni pogon, od 259 brt. Jedrenjak je bio dug oko 36,30 m, širine oko 7.90 m, i visine 3.60 m, a visina jarbola je bila gotovo 30 m. Prvi zapovjednik broda bio je Nikola Turina, kapetan duge plovidbe a brod je svečano stigao u Bakar sa zapovjednikom Turinom, ravnateljem škole Eugenom Kavićem i prvim strojarom Josipom Sinčićem
8. listopada, nakon 34 dana plovidbe od Kiela. Brod je u Bakru svečano kršten pod imenom Vila Velebita. Cilj Vile Velebita bila su kratka znanstvena putovanja, kao i prethodnog broda Margita. Godine 1913. započelo je prvo veliko istraživačko putovanje za učenike završnih triju razreda. Bilo je to putovanje od Trsta do Kotora u trajanju od 45 dana. Tijekom 1914. Vila Velebita izvršila znanstvena putovanja u vodama Cresa, Lošinja, Krka, Raba, Paga i Silbe. Ova znanstvena putovanja opisana su u djelu Prirodoslovna istraživanja Hrvatske i Slavonije, sv. 2, 1913. i sv. 5, 1914., kao i u posebnom izdanju Dr. V. Vouka, Vila Velebita u službi znanosti.
Rat je prekinuo istraživanja tako da je školski brod do 20. svibnja 1915. mirovao u Bakru, a kasnije do 29. studenog 1918. u Obrovcu. Nakon Prvog svjetskog rata, Vila Velebita nastavlja sa znanstveno-istraživačkim putovanjima, ploveći do Messine, Napulja, Genove, Marseillesa,
Barcelone, Alžira i Krfa. Takva istraživačka putovanja nastavljena su tijekom 1923. po Jadranskom moru, 1924. po istočnom Sredozemlju, i to s kadetima kotorske, bakarske i dubrovačke pomorske akademije. Godine 1925. Vila Velebita putovala je s kadetima bakarske pomorske akademije do Patrasa i Atene.
U sljedećem desetljeću Vila Velebita, obavljala je plovidbe i znanstvena istraživanja po Sredozemlju, tako da su posada i učenici Pomorske škole Bakar, boravili u svim velikim lukama, kao što su Marseilles, Barcelona, te u lukama Grčke i Turske. U drugoj polovici tridesetih godina, Vila Velebita je većinom bila u Jadranskim lukama, od Bakra pa sve do Kotora. I konačno najduže putovanje prije drugog svjetskog rata, bakarski školski brod obavio je 1935/1936. na liniji Bakar-Krf- Istanbul.