Razstava predstavlja arheološke najdbe v obmorskem pasu, na morskem dnu ter in kopenskih najdišč Slovenske Istre, od mlajše kamene dobe do pozne antike ter srednjega veka.
Opis
Leta 1954 je tedaj še Mestni muzej v Piranu pridobil prve arheološke najdbe, saj so bile ob regulaciji reke Dragonje najdene amfore, keramika in steklo. Leta 1955 muzej pridobi prve podvodne najdbe (to je štiri rimske amfore, najdene na morskem dnu v bližini piranske Punte). Let 1967 se Mestni muzej preimenuje v Pomorski muzej "Sergej Mašera" in tudi arheološka razstava je pridobivala na pomorsko vsebini. Stara arheološka razstavo so prenesli v pritličje, jo prenovili in odprli leta 1979 pod avtorstvom kustosinje arheologinje Elice Boltin-Tome. Osrednja tema razstave je bila vloga morja pri razvoju ekonomskega in kulturnega življenja dežele v najstarejših kulturnozgodovinskih okoljih.
Prostor arheološke zbirke je bil ponovno obnovljen leta 1999, takrat je bila v muzeju že zaposlena sedanja kustosinja, arheologinja Snježana Karinja. Prostor je dobil stekleni tlak, ki ponazarja morje. Sedanja razstava nosi naslov Med morjem in kopnim in je bila odprta leta 2002. Na razstavi so predstavljene najstarejše pomorske poti ob severovzhodni obali Jadranskega morja, od mlajše kamene dobe do pozne antike ter srednjega veka. V vitrinah nad tlakom so predstavljene kopenske najdbe, pod tlakom pa podmorske najdbe. Med najdbami izstopa apulski krater iz 6. stol. pr. n. št.. Posebej so razstavljeni rimski arheološki ostanki iz območja rimskih obmorskih vil, naselbin in pristanišč (Fornače, Fizine, Lucije, Grubelce pri Sečovljah, ...).